공학생물 단백질 구조 예측

소개

공학생물 단백질 구조 예측

목차

1.도입
2. 배경이론
3. 예측 과정
4. 결론

본문내용

1.도입

단백질 구조의 예측은 생물학적 지식과 기술, 우리의 생활에도 큰 도움을 가져올 수 있다. 하지만 아미노산 서열에 따른 단백질의 구조를 예측하는 것은 어느 정도로 정확하게 가능성을 예측할 수 있는가의 문제이기 때문에 기술적으로 쉽지 않은 과정이다. 따라서 현재까지도 단백질 구조의 예측은 풀리지 않은 숙제이며 다만 현재까지의 연구결과를 토대로 데이터베이스를 이용해 컴퓨터 프로그램을 통해 어느 정도만 예측할 수 있을 뿐이다.
단백질의 구조 예측은 차원에 따라 생각해 볼 수 있다. 먼저 1차 구조를 이용한 예측에서는 분자 역학적 방법을 이용할 수 있는데 이것은 너무 많은 시간이 걸리고, training set에 의한 방법으로는 방대한 단백질의 양에 비해 구해진 자료의 양이 많아 어려움이 있다. 둘째로 2차 구조를 이용한 예측에서는 sequence로부터 구조를 예측할 수 있는데 이에 alpha-helix, beta-sheet, random coil등의 구조가 이용된다. Sliding window는 중심 아미노산의 구조를 예측하는 것인데 적은 정보에 대한 의존성이 크다.
우리는 수업 시간에 단백질의 기본 구조인 아미노산과, 단백질 구조의 기본 원리가 되는 아미노산 사이의 여러 가지 결합에 대해 배웠다. 우리는 그 내용을 토대로 주어진 sequence로부터 단백질의 모양을 예측하고, 그것을 컴퓨터 프로그램으로 확인해서 우리가 예측한 단백질의 형태를 완성하여 마지막으로 전문 기관에 의뢰해 얻은 결과와 비교해 보고 도식화하기로 하였다.


2. 배경이론

● 단백질이란 ?

수많은 아미노산(amino acid)의 연결체로 20가지의 서로 다른 아미노산들이 펩타이드 결합이라고 하는 화학 결합으로 길게 연결된 것을 폴리펩티드(polypeptide)라고 한다. 여러가지의 폴리펩티드 사슬이 4차구조를 이루어 고유한 기능을 갖게되었을때 비로소 단백질이라고 불리며 단백질과 폴리펩티드는 엄밀히 말하면 다른 분자이지만 경우에 따라 구분없이 쓰이기도 한다. 일반적으로는 분자량이 비교적 작으면 폴리펩티드라 하고, 분자량이 매우 크면 단백질이라고 한다.

참고자료

· 없음