돼지모색과 관련 후보유전자 ASIP(Agouti signalling protein):A Candidate Gene or ASIP Involved in Porcine Coat Colors

소개글

ASIP cDNA는 사람, 마우스, 소(cattle), 개(dog)와 여우(fox)에서 밝혀졌는데(bultman et al.1992; Kwon et al. 1994; Vage et al. 1997; Kerns et al. 2004; Girardot et al. 2005; Cord et al. 2006) ASIP 유전자는 약 700염기의 cDNA를 지정하는 4개의 엑손으로 구성되어있다(Chowdhary B.P. et al. 1993; Sturm R.A. et al. 1994; Hawkins G.A. et al. 1996; Kappes S.M. et al. 1997; Buitkamp J. et al. 1998). 번역되지 않는(untranslated) 1번 엑손이 나머지 3개의 엑손으로부터 상당히 멀리 떨어져 있는데 이 3개의 엑손은 5 kb 의 genomic DNA 내에 포함되어있다

목차

서론(Introduction)
본론(Main)
소견(Comment)

본문내용

ASIP cDNA는 사람, 마우스, 소(cattle), 개(dog)와 여우(fox)에서 밝혀졌는데(bultman et al.1992; Kwon et al. 1994; Vage et al. 1997; Kerns et al. 2004; Girardot et al. 2005; Cord et al. 2006) ASIP 유전자는 약 700염기의 cDNA를 지정하는 4개의 엑손으로 구성되어있다(Chowdhary B.P. et al. 1993; Sturm R.A. et al. 1994; Hawkins G.A. et al. 1996; Kappes S.M. et al. 1997; Buitkamp J. et al. 1998). 번역되지 않는(untranslated) 1번 엑손이 나머지 3개의 엑손으로부터 상당히 멀리 떨어져 있는데 이 3개의 엑손은 5 kb 의 genomic DNA 내에 포함되어있다(Fig. 1,T Leeb et al.2000).
7개의 돼지 품종(German Landrace, German Large White, Pietrain, Angler Saddleback, Duroc, Bunte Bentheimer, and wild boar)의 9마리 개체의 4개의 엑손 부위 분석을 통해 이 유전자의 코딩되지 않는 지역에서 3개의 다형성이 관찰되었는데 이러한 다형성 중 한개는 인트론 1번째의 염기 C의 길이와 관련 있고 나머지 2개는 단일염기다형성(single nucleotide polymorphisms, SNP)과 관련이 있다(T Leeb et al. 2000).

참고 자료

1. Buitkamp J. et al. (1998) Anim Genet 29, 295-301.
2. Bultman SJ, Michaud EJ, Woychik RP (1992) Molecular characterization of the mouse agouti locus. Cell 71, 1195-1204.
3. Chowdhary B.P. et al. (1993) Chromosome Res 1, 175-9
4. Cord Drögemüller, Alexander Giese, Fla´via Martins-Wess, Sabine Wiedemann, Leif Andersson, Bertram Brenig, Ruedi Fries, Tosso Leeb (2006) The mutation causing the black-and-tan pigmentation phenotype of Mangalitza pigs maps to the porcine ASIP locus but does not affect its coding sequence. mammalian genome Volume 17, 58-66.
5. Girardot M, Martin J, Guibert S, Leveziel H, Julien R, et al. (2005) Widespread expression of the bovine Agouti gene results from at least three alternative promoters. Pigment Cell Res 18, 34-41.
6. Harris RB, Mitchell TD, Mynatt RL (2002) Leptin responsiveness in mice that ectopically express agouti protein. Physiol Behav 75, 159-167.
7. Hawkins G.A. et al. (1996) Mamm Genome 7, 474-5.
8. Jackson I.J. et al. (1992) EMBO 11, 527-35.
9. J. M. H. Kijas, A Tornsten, B. Chowdhary & L. Andersson (1998) (PIG)
GENE MAPPING REPORT. Chromosome Research , 6, 243.
10. Kappes S.M. et al. (1997) Genome Res 7, 235-49.
11.Kerns JA, Newton J, Berryere TG, Rubin EM, Cheng JF, et al. (2004) Characterization of the dog Agouti gene and a nonagoutimutation in German Shepherd Dogs. Mamm Genome 15, 798-808.
12.K. R. Shi, A. G. Wang, X. F. Yuan, X. M. Deng and N. Li (2006) Analysis of the MC1R, KIT and ASIP loci in Chinese and European pigs.
International Society for Animal Genetics, Animal Genetics, 37, 293-307.
13.K. S. Kim, E. A. Mendez, S. Marklund, A. C. Clutter, D. Pomp, and M. F. Rothschild (2000) Rapid communication: Linkage mapping of the porcine Agouti gene. J. Anim. Sci. 78:1395–1396.
14.Kwon HY, Bultman SJ, Loffler C, Chen WJ, Furdon PJ, et al. (1994) Molecular structure and chromosomal mapping of the human homolog of the agouti gene. Proc Natl Acad Sci USA 91, 9760-9764.
15.Lee M. K. et al. (2003) Anim Genet 34, 151-2.
16.Sturm R.A. et al. (1994) Genomics 21, 293-6.
17.T. H. Kim, B. H. Choi and J. E. Beever (2004) Polymorphism in the porcine agouti signalling protein (ASIP ) gene. International Society for Animal Genetics Animal Genetics, 35, 408–423.
18.T Leeb, A Deppe, B Kriegesmann, B Brenig (2000) Genomic structure and nucleotide polymorphisms of the porcine agouti signalling protein gene (ASIP).International Society for Animal Genetics, Animal Genetics 31, 333-346.
19.Vage DI, Lu D, Klungland H, Lien S, Adalsteinsson S, et al. (1997) A non-epistatic interaction of agouti and extension in the fox, Vulpes vulpes. Nat Genet 15, 311-315.