[이화여대 생명과학실험3 분반1등 A+ 레포트] Genotyping

소개글

이화여자대학교 생명과학실험1 과목 A+ 레포트입니다.
정성 들여 작성했습니다. 참고하시어 좋은 결과 있으시길 바랍니다.

목차

I. 실험 목표

II. Introduction
1. Genotyping
① DNA Extraction
② PCR
③ Gel Electrophoresis
2. SIRT1과 PASKIN

III. Materials & Methods
1. 실험 도구 (Materials)
① Genomic DNA Extraction
② PCR
③ Gel Electrophoresis
2. 실험 방법 (Methods)
① Genomic DNA Extraction
② PCR
③ Gel Electrophoresis

IV. Results

V. Discussion
1. Analyzing and Interpreting the Gel Electrophoresis with DNA Ladder
2. 정리

VI. References

본문내용

I. 실험 목표
Mouse의 발가락에서 유래한 DNA를 통해 SIRT1과 PASKIN 단백질의 sample 별 genotype을
분석한다. 해당 실험을 통해 genotyping의 과정을 알아보고, 생물학적 연구에 대한
genotyping의 의의를 이해한다.

II. Introduction
1. Genotyping
Genotyping(유전형 분석)은 생물학적 분석을 이용한 DNA 염기 서열 조사를 통해 genotype의 차이점을 결정하는 것이다. 특정 단백질을 이루는 유전자가 궁금할 경우 genotyping을 이용하여 genotype을 유추할 수 있으며, 특정 질병에 영향을 미치는 유전자의 유무를 밝혀내는 등 다양한 생물학적 연구에 활용된다.1) Genotyping은 3가지 단계로 구성된다. (3 Steps of Genotyping)
① DNA Extraction
Mouse에서 유래한 tissue(본 실험에서는 mouse의 발가락을 사용하였다)로부터 DNA를 추출하는 과정으로, cell lysis를 통해 세포벽을 파괴한 뒤 RNA와 단백질을 제거하여 DNA만 얻는 것을 목표로 한다. DNA purification을 거치는 방식, 그리고 DNA purification을 거치지 않는 방식으로 나뉘며, 본 실험에서는 DNA purification을 거치지 않는 간소화된 방식(Method 2)을 사용하여 실험을 진행한다.
• Method 1 with DNA purification
a) Mouse 발가락이 담긴 1.5㎖ tube에 lysis buffer 290㎕와 proteinase K(10㎍/㎕) 10㎕을 넣고 충분히 vortexing 및 spin down을 한다. 이때 proteinase K는 단백질인 DNase를 제거하여 DNA가 분해되는 것을 막는다.

참고 자료

검색어 「genotyping」, 『IDT』, https://sg.idtdna.com/pages/applications/genotyping, 접속일2024.05.09.
Hung-Chun Chang, Leonard Guarente, SIRT1 and other sirtuins in metabolism, Trends in
Endocrinology & Metabolism, Volume 25, Issue 3, 2014, Pages 138-145, ISSN 1043-2760,
https://doi.org/10.1016/j.tem.2013.12.001.
검색어 「PASK」, 『Promega』, https://www.promega.kr/products/cell-signaling/kinaseassays-and-kinase-biology/pask-kinase-enzyme-system/?catNum=V4240, 접속일 2024.05.09