1. 실험제목
2. 실험목적
3. 실험원리
4. 실험 재료 및 방법
5. 실험 결과
6. 실험에 대한 고찰
7. 추가 자료 조사
8. 참고문헌
본문내용
실험원리
비교하고자 하는 서열을 다운로드한 후 다운받은 서열을 정리해 서열간의 상동 정도를 비교한다. 이후 Alignment 파일을 TreeView 프로그램을 이용하여 phylogenetic tree로 변환해 비교한 종들 간의 진화적 관계를 파악한다.
실험 재료 및 방법
<실험 재료>
인터넷 연결 가능한 컴퓨터, TreeView program
<실험 방법>
1. NCBI( https://www.ncbi.nlm.nih.gov/ )에 접속하여, 비교하고자 하는 생물 종들의 5S ribosomal DNA 서열이나 해당과정에 관련된 효소 유전자의 서열을 검색하여 download 한다.
2. Down 받은 서열들을 FASTA form으로 정리한 후, ClustalW multiple sequence alignment program ( https://www.ebi.ac.uk/Tools/msa/kalign/ )을 이용하여 서열 간의 상동성 정도를 비교한다.
3. Alignment 파일을 TreeView program을 이용하여 phylogenetic tree로 변환하여 비교한 종들 간의 진화적 관계를 확인한다.
참고자료
· 계통수 (naver.com)
· https://www.ibric.org/myboard/read.php?id=1110&Board=report
· How to build phylogenetic species trees with OMA - PMC (nih.gov)
· 유전자계통수 (naver.com)
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