게놈 브라우저와 ncbi등 프로그램을 이용하여 암억제유전자 얻기 보고서입니다.

소개

"게놈 브라우저와 ncbi등 프로그램을 이용하여 암억제유전자 얻기 보고서입니다."에 대한 내용입니다.
암연구원, 항암치료제 연구원을 꿈으로 하시는 분들이 동아리나, 생명과학, 자율활동으로 쓰기 좋은 보고서입니다. 생명계열 지원하시는 분들도 좋습니다. 컴퓨터 프로그램을 통해 암유전자를 찾아내는 것인데, 이렇게 프로그램을 통해 dna를 찾아내는 것은 생명계열 관련 연구원으로써 필수로 요구되는 능력입니다. 때문에 대학원이나 대학교 때 배우는 것인데 고등학교 때 이 활동을 한다는 것은 이 학과에 대한 높은 관심과 일반 다른 실험에 비해 특이성을 들어내기에 좋습니다.

목차

1.탐구동기

2.이론적 배경
(1)UCSC Genome browser
(2)NCBI
(3)BLAST
(4)TP53

3. 탐구수행
(1)UCSC Genome browser를 이용
(2)NCBI를 이용
(3)BLAST를 이용

4.느낀점

5. 활동정리

본문내용

1.탐구동기
여러 생명공학 논문에서 게놈에 대한 정보를 찾을 때 UCSC Genome browser나 NCBI를 이용하여 유전정보를 찾는것을 보았다. 이 프로그램이 신기하여 이 프로그램의 도구를 이용하는 법을 배우고 내가 관심있는 암에 대해 암억제유전자인 tp53을 알아보고자 한다.

2.이론적 배경

(1)UCSC Genome browser

유전체 브라우저(genome browser)는 사용자가 원하는 유전체(genome)의 특정 부분을 보여주는 인터넷 사이트(web page) 혹은 프로그램(software)이다. 생명체의 DNA가닥은 무척 긴 염기서열(sequence)로 이루어져있기 때문에 필요한 유전자(gene)의 위치정보와 유전자 주석달기(Gene annotation)정보를 효율적으로 검색할 방법이 필요하다. 캘리포니아 대학교 샌타크루즈(University of California, Santa Cruz, UCSC)가 관리하는 UCSC 유전체 브라우저(UCSC Genome Browser, 그림 1)와 Ensembl 유전체 브라우저(Ensembl genome browser)가 대표적이다. 유전체 브라우저는 서열과 유전자 구조(엑손, 인트론, 전사방향 등)뿐만 아니라 다양한 다른 정보들(유전자 변형, 동형 전사체, 메틸화 위치, 예측된 유전자, 삭제 표현형, 다른 종에서 유전자 보존 유무, 발현량 등)도 함께 보여준다. 이들 정보의 통합은 브라우저가 보여주는 해당 영역의 유전자 기능을 이해하는 데 도움을 준다.

UCSC 유전체 브라우저는 논문과 같이 문헌으로 축적된 정보들을 생물정보학 기술을 이용해 수집하고 브라우저에 적용했다. 인터넷 사이트(webpage)의 "track" 항목에 가 보면 mRNA의 정렬, 반복되는 DNA 서열에 대한 정보, 유전자의 발현(expression) 정보, 질병과 관계된 유전자에 대한 정보가 소개되어 있다.

참고자료

· 없음