[예비레포트] in-sol digestion

소개글

"[예비레포트] in-sol digestion"에 대한 내용입니다.

목차

1. Sμbject 실험 제목

2. Object 실험 목표

3. Principle 실험 원리
(1) Proteomics
(2) Digestion
(3) Denaturation
(4) DTT(Dithiothreitol)를 이용한 Reduction
(5) IAA와 IA를 이용한 Alkylation
(6) trypsin
(7) In-gel digestion
(8) In-sol digestion

4. Procedure 실험 방법

본문내용

1. Sμbject 실험 제목
:　In-solution Digestoin

4. Object 실험 목표
: 대표적인 digestion 방법인 in-sol digestion과 in-gel digestion의 원리를 살피고, In-sol digestion을 실험해봄으로써 bottom-up proteomics process의 기본을 익힐 수 있도록 한다.

5. Principle 실험 원리
(1) Proteomics
: 유전자의 기능을 밝히는 총체적인 연구분야를 "Functional Genomics" (이하 유전체기능분석학) 라고 정의 하며, 여기에는 기술적으로 DNA 나 RNA를 시료로 사용하여 수행하는 지노믹스(Genomics: 이하 유전체학), 단백질을 대상으로 연구하여 유전자기능을 연구하는 프로테오믹스(Proteomics: 단백질체학-편의상 이하 프로테오믹스라고 칭한다), 그리고 이 두 분야를 지원하는 바이오인포매틱스(Bioinformatics: 이하 생물정보학)로 각각 구분된다.
프로테옴(proteome) 이란 말은 어원적으로 단백질체 (protein-body (-some) 라고 풀이 할 수 있으나, 실제로는 게놈(Genome)의 상대어로서 <PROTEin expressed by a genOME>의 합성어로 인식되고 있는 말 이다 (Williams K. & Hochstrasser DF, 1997). 프로테오믹스는 프로테옴(proteome)의 어미에 ∼학, ∼론을 의미하는 접미사 -ics 가 붙어 프로테옴을 연구하는 방법과 technique을 포괄적으로 의미하는 말로, 굳이 번역한다면 '프로테옴분석학' 이라고 해야 할 것이다. 즉, 단백질의 성질을 발현, post-translational modification, 다른 단백질과의 결합에 초점을 두어 연구하여 세포 내 변형과정과 네트웍 형성을 질병의 진행과정과 연계시켜 총괄적으로 이해 할 수 있는 연구 분야를 뜻한다.

참고 자료

Linda Switzar Martin Giera and Wilfried M. A. Niessen / Protein Digestion: An Overview of the Available Techniques and Recent Developments / J. Proteome Res. 2013, 12, 3, / pp. 1067–1077
[Creative proteomics] Protein Digestion Service/ https://www.creative-proteomics.com/services/digestion-in-gel-or-in-solution-2.htm / 2021-04-25
[LCGC] Top-Down versus Bottom-Up Approaches in Proteomics/ https://www.chromatographyonline.com/view/top-down-versus-bottom-approaches-proteomics-0 / 2021-04-26
[Promega] Protease Digestion for Mass Spectrometry https://www.promega.kr/resources/guides/protein-analysis/protease-digestion-for-mass-spec/ / 2021-04-26