Dopamine receptor D4의 삼차원 단백질 구조를 예측하기

소개글

Dopamine receptor D4의 삼차원 단백질 구조를 예측에 대한 생물정보학 레포트 입니다.
예측까지 알아내는 자세한 과정이 나왔습니다.
성적 A+나왔습니다.

목차

없음

본문내용

1. Dopamine receptor D4의 Amino acids 서열을 알기위해 NCBI에서 검색한다.
(NCBI→PROTEIN→ Dopamine receptor D4→ Homo sapiens→FASTA)

<중 략>

3.가장 유사한 template을 다섯가지 고른다.

이때 , 가장 유사한 구조를 찾아야하는데 이때 사용하는 조건은 coverage와 Identity이다.
-Ident: 서열의 상동성이 높을수록 정확한 모델링이 가능하다. 70% 이상이 매우 좋은 경우인데 높은 서열이 첫번째로 좋은 경우는 아니기 때문에 다른 경우를 생각해야한다
-coverage:검색한 protein과 아미노산 서열의 공통된 정도.
Identity가 높다고 가장 유사한 것이 아니기 때문에 coverage의 값까지 두가지를 적절한 조건에서 선택하는데. Identity는 27%까지 그리고 coverage는 0.82 범위에 있는 상위 5가지를 선택한다.

참고 자료

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