mRNA Untranslated region

소개

mRNA에 존재하는 UTR에 대하여

목차

없음

본문내용

DNA로부터 transcription된 mRNA는 그 구조를 크게 나누어 보면 5‘UTR-ORF-UTR'3 으로 표현된다. 이때 ORF는 open reading frame으로 protein의 N-term amino acid로부터 C-term amino acid까지의 정보를 담고 있는 염기 서열이며, UTR은 untranslated region으로 protein으로 translation되지 않는 염기서열을 말한다. 대부분의 ORF의 첫 번째 codon은 protein의 합성을 개시하는 AUG(Met)가 되며 그 마지막은 UAA, UAG, UGA들 중 하나로 이루어져 있다. ORF 내에 있는 염기들은 codon을 이루며 anticodon을 가진 tRNA들과 대체로 상보적이다.(Wobble position으로 완벽히 상보적일 필요는 없다.) 이에 비해 UTR 부분은 start codon의 upstream 지역과 stop codon의 downstream 지역에 존재하는 염기서열로써 protein으로 translation되지 않는 서열이다. 즉 tRNA에 의해 protein으로 translation되지 않는 염기들이 mRNA의 5’,3‘ 지역에 ORF를 가운데 두고 존재하고 있다는 것인데 이들의 존재 의미는 무엇일까?

<중 략>

E.coli와 같은 prokaryote의 mRNA도 eukaryote와 유사하게 UTR을 가지고 있는데 prokaryotic cell의 ribosome의 소단위체인 16S rRNA의 염기순서가 밝혀지며 5‘UTR과 ribosome의 연관성이 규명되었다. mRNA는 translation되기 위해 작은 단위체의 ribosome이 mRNA와 결합하여 initiation complex(30S 또는 40S)를 형성하고 큰 단위체의 ribosome이 여기에 결합해 전체 initiation complex(70S 또는 80S)가 형성되어야 translation이 시작된다.

참고자료

· Molecular Biology of The Cell, Garland Science
· Biochemistry, Freeman
· Christine Mayr and David P. Bartel, "Widespread shortening of 3`UTRs by alternative cleavage and polyadenylation activates oncogenes in cancer cells", Cell, August 21, 2009.
· Anuradha Mehta1, Christopher R. Trotta, and Stuart W. Peltz, "Derepression of the Her-2 uORF is mediated by a novel post-transcriptional control mechanism in cancer cells", Gene&Development, April 5, 2006.