Complex Ⅰ은 iron-sulfur cluster로부터 활성산소(O)를 만들어낸다. 활성산소(O)는 미토콘드리아의 매트릭스로 가서 Mn-SOD(SuperOxide Dismutase)에 의해 중화된다. Complex Ⅰ & Ⅲ에 의해 나오는 활성산소(O)는 미토콘드리아 내막의 lipid peroxidation을 일으킬 수 있고, mtDNA에 손상을 가할 수 있다. 특히 Complex Ⅲ에서 나오는 활성산소(O)는 nuclearDNA를 포함한 세포 전체에 손상을 가할 수도 있다. CoQ는 활성산소(O)에 대항하는데 중요하다. [ACTA BIOCHEMICA POLONICA; Nohl,H; 51(1):223-229 (2004)] [THE JOURNAL OF NEUROSCIENCE; Tretter,L; 24(36):7771-7778 (2004)] [JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY; Muller,FL; 279(47):49064-49073 (2004)]
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