차세대 초고속 서열 분석 기능이라고 불리는 next-generation sequencing(NGS)는 단시간에 적은 비용으로 많은 서열을 분석할 수 있는 장점을 지니고 있으며, 2005년에 처음으로 출시되어 유전학 모든 분야에서 사용되고 있다. Roche사에서 처음으로 GS 454-FLX System이라는 이름으로 NG-sequencer를 출시하였고, 이후로 2007년 초에 시장에 나온 Illumina의 Genome Analyzer, 그리고 2007년 말에 시장에 소개된 AB system의 SOLiD system, 이렇게 세 가지 NG-sequencers들은 이미 세계 각지에 보급되어 de novo sequencing, whole-genome re-sequencing, mRNA sequencing, microRNA sequencing, ChIP-sequencing, 그리고 methylation analysis 등등 유전체학의 모든 분야에서 널리 쓰이고 있다.
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